向國內外地學界開放共享國家大型科學儀器是北京二次離子探針中心運行的基本方針。該中心成立3年來，每年的機時分配為國土資源部40%，中科院20%，各高校20%，港臺地區8%，國外12%。共有來自國土資源部相關單位、中科院、大專院校以及港臺地區的30多個單位的107名科研工作者使用中心的SHRIMP II對自己的樣品進行分析研究，同時一大批來自美國、英國、法國、意大利、德國、澳大利亞、韓國、巴西、古巴等國的學者也來中心上機操作。3年來，每年的凈分析機時（指儀器進行樣品或標準樣品分析的時間）都超過了原定200晝夜24小時不間斷運行的指標。 2004年全年凈分析機時更是高達301晝夜。
據測算，北京二次離子探針中心SHRIMP II利用率和開放程度居國際同類實驗室的前列。同類儀器中僅有澳大利亞的兩個實驗室與該中心有相近的開放程度和高效率。美國的一臺因技術原因正常運行時間不到中心的1/3。日本的兩臺已經基本上不能工作。俄羅斯的一臺每天僅工作12小時，運行時間不足該中心的1/2。
共享產生高水平成高使用率實現了設備投資的高收益，最大限度地為廣大地球科學家提供了機會。